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關于蛋白電泳中的SDS聚丙烯酰胺凝膠

 更新時間:2022-03-24 點擊量:1921

蛋白電泳是研究蛋白質性質的一種相對簡單、快速和高靈敏度的工具。它是分析化學、生物化學和分子生物學的主要工具。通過電泳分離蛋白質是基于這樣一個事實,即帶電分子將在施加電場時通過基質遷移。蛋白質電泳分離的基質是聚丙烯酰胺。 用于形成聚丙烯酰胺的化學試劑是單體丙烯酰胺和N,N'-雙丙烯酰胺(雙-丙烯酰胺)。聚合丙烯酰胺和雙丙烯酰的方法是使用 TEMED(四*基乙二胺)和過硫酸銨。聚丙烯酰胺凝膠內部的聚合形成了一個交聯的微孔網絡。這種孔隙網絡允許小蛋白質分子快 速通過,同時減緩較大蛋白質的遷移。這導致基于其分子大小的蛋白質分離。



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聚丙烯酰胺凝膠基質中孔的大小由每單位體積使用的總丙烯酰胺的量和使用的雙丙烯酰胺的相對百分比確定。聚丙烯酰胺凝膠的有效范圍在3-30%之間。

SDS PAGE(SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳)存在兩種根本不同類型的凝膠系統,非解離(非變性)和解離(變性)。非解離(非變性)系統旨在在保留蛋白質功能和活性的條件下分離天然蛋白質。相比之下,解離系統旨在將蛋白質變性為其成分的多肽,從而檢查樣品的多肽組成。變性系統可能經常用的,被稱為 SDS-PAGE。

SDS-PAGE 蛋白質鑒定過程中使用的 SDS 代表十二烷基硫酸鈉,一種陰離子去污劑,可使蛋白質變性并將每個多肽鏈展開成線性方向。SDS 還根據其質量對每種蛋白質施加均勻分布的負電荷。

在 SDS-PAGE 中,蛋白質混合物通過在 100°C 下在過量 SDS 存在下加熱而變性,并使用還原劑(β-巰基乙醇、TCEP、DTT)來破壞二硫鍵。在這些條件下,所有還原的多肽結合相同量的 SDS(1.4g SDS/g 多肽),與蛋白質的氨基酸組成和序列無關。SDS-蛋白質復合物形成一個桿,其長度與蛋白質的分子量成正比。所有蛋白質現在都帶負電荷,電荷密度相似,因此可以僅根據它們的大小進行分離。

SDS-PAGE 主要用于以下目的:

1. 蛋白質大小的估計。

2. 蛋白質亞基或聚集結構的測定。

3. 蛋白質純度的估計。

4. 蛋白質定量。

5. 監測蛋白質完整性。

6. 比較不同樣品的多肽組成。

7. 分析多肽亞基的數量和大小。

8. 蛋白電泳后應用,例如蛋白質印跡。

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    實驗中的SDS-PAGE使用DIY自行配置的話需要1個小時左右,比較耗時費力,目前很多實驗室為了提升實驗效率一般選用提前配置好的預制膠,比如天能的Biofuraw Precast Bis-Tris Gel 系列預制膠,在電泳過程中有效避免了Tris-甘氨酸SDS-PAGE凝膠所出現的“外八"現象,跑膠效果穩定均一。在節約用戶時間的同時,也保證了實驗的質量。

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